Ниер: Автомата — Версия 1.1а

Действие происходит в 5012 году, после вторжения на Землю инопланетных сил, известных как «Машины». Эти существа, использующие роботизированные формы, почти полностью уничтожили человечество. Оставшиеся люди создали на Луне военное подразделение андроидов YoRHa для борьбы с захватчиками и возвращения планеты. Андроид 2B, член этого подразделения, известна своими боевыми навыками. Её напарником становится андроид 9S, специализирующийся на разведке и хакерских атаках.

2B и 9S отправляются на Землю с заданием по устранению угрозы со стороны Машин. В ходе миссии они обнаруживают, что некоторые Машины развили признаки осознанности и эмоций, а их отношение к людям не всегда является враждебным. Параллельно андроиды находят уцелевших людей, которые скрываются в руинах разрушенного мира и пытаются выжить.

По мере продвижения миссии 2B и 9S выясняют, что за конфликтом между человечеством и Машинами может стоять более могущественная и скрытая сила, манипулирующая событиями. Герои продолжают расследование, раскрывая новые детали о происхождении войны и собственной организации YoRHa. Сюжет ведёт к финальному противостоянию, от исхода которого зависит дальнейшая судьба всех сторон конфликта.